朱熹哲學的核心是“理”?！袄怼笔瞧湔軐W的出發點和歸宿，但它必須借助于“氣”而“造作”，依“氣”而“安頓”；“物”是“理”的體現和表象，是“理”借“氣”而派生的。他說：
未有天地之先，畢竟也只是理。有此理，便有此天地；若無此理，便亦無天地，無人無物，都無該載了。有理，便有氣流行，發育萬物【《朱子語類》卷一，中華書局，1981年，1頁。】。
在朱熹的哲學中，“理”不僅是宇宙萬物的本原，而且是人類社會的最高原則。“理”不僅具有先天性，而且又是一個不變不動的清凈之體，“若理，則只是凈潔空闊底世界，無形跡，他卻不會造作”【《朱子語類》卷一，3頁?！?/FONT>。同時，“理”也是“極好至善的道理”【《朱子語類》卷一○○，2549頁?！?/FONT>，在未發之前處于無形無言無位的絕對空靜狀態中，但是又包孕著動靜兩端，在動靜陰陽中涵蘊著萬事萬物【《朱子語類》卷九四，2369頁。】。但是，在這種“理”的本體地位下，理為本，氣為末。由于“理”雖然是絕對的“一”，但是“氣”卻分陰陽之“氣”，生五行之“質”，陰陽五行化生萬物【《朱子語類》卷一，9頁?！?/FONT>，于是，統一的“理”在萬事萬物中卻有種種不同的呈現。
朱熹“理”與“氣”的關系，與《起信論》中“心真如門”與“心生滅門”關系十分相似。尤其對于“理”的規定，更是“心真如門”相似。而且，朱熹同樣引入了“理一分殊”，他說：
或問理一分殊，曰：圣人未嘗言理一，多只言分殊。蓋能于分殊中事事物物、頭頭項項分得其當然，然后方知理本一貫。不知分殊各有一理，而徒言理一，不知理一在何處？圣人千言萬語教人，學者終身從事，只是理會這個要得事事物物、頭頭件件各知其所當然，而得其所當然，只此便是理一矣【《朱子語類》卷二七，677～678頁?！?/FONT>。
朱熹把太極作為宇宙的本體，太極是宇宙的普遍規律、萬物的存在根據。一切萬物都稟受此理以為性，以為體。萬物之性雖然是“分”（稟受）自太極而來，但并不是分有了太極的一部分，因為每一物的性理與作為宇宙本體的太極是相同的，所以說“萬物之中各有太極”。所以，這種“理一分殊”與《起信論》的“心真如”也是十分相似，萬物都具備真如理，萬物的真如是平等無差別的，所以能“一多相攝”，也就是“理一分殊”了。
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