在《楞嚴經》等大乘經典中，佛陀著重宣說了戒殺斷肉以及素食的功德。如《楞伽經》中云：“得生梵志種，及諸修行處，智慧富貴家，斯由不食肉?！薄斗鹫f十善戒經》云：“啖肉者多病，當行大慈心，奉持不殺戒?！币虼嗽跉v史上梁武帝也根據《涅槃經》等佛經教義，出于慈悲心腸反對吃葷，著《斷酒肉文》四篇，主張僧尼一律斷魚肉，他又召集三律師入宮會議，使僧尼斷肉食素，從此在漢地佛教徒中吃素成為了良好的定制。直到如今在漢地絕大多數寺院的法師、居士都在堅持吃素，獲得佛經所說的無量斷肉功德。
但在食肉的問題上，藏地及奉行上座部的東南亞地區與漢地有著不同的傳統習慣，又均有教證依據，欲解釋此現象、推知佛經的深奧意義，應根據具德上師的教言、清凈的傳承、以及廣大的智慧，以此方能了知各種經論的不同破立之處。
有人以為藏地食肉是密宗風行所致，事實并非如此。確實基于密宗最高的見地，吃肉與雙運、降伏等一樣皆屬于密宗的最高行為，但這僅對于證悟很高的瑜珈師而言，非一般凡夫所能企及。如大成就者帝洛巴常吃生魚，那洛巴對此未生起邪見，如理依止后，也獲得了究竟成就。又如漢地濟公和尚一生吃肉喝酒，然人們依然推崇其為圣者的權巧示現，而未敢譏侮或效仿一樣。藏地佛教徒食肉的習俗，即是基于高原地理不長莊稼的客觀現實，以本師釋迦佛在別解脫戒中的方便開許為根據而形成的。
印度律宗祖師功德光和釋迦光在各自所著的《律經根本律》與《毗奈耶三百頌》中都開許食用三凈肉。又《毗奈耶經·藥事品》中云：“世尊告，不得食用非清凈之肉?！薄堵蓛x經》云：“觀察缽中之魚肉等，若非人肉等，則可食用?！庇《劝㈥^梨巴西在《中觀精華論》中云：“聲聞乘論中，開許三凈肉，食亦無過失，已成精等故，如 乞食無過……食肉非有過，時眾無害故?！薄吨杏^精華論釋》中亦云：“大悲怙主釋尊者，于大乘經典不僅未開許食肉，且云遮止。小乘經中食用三凈肉亦說無過失?！贝巳粌羧?，多數智者根據《律儀頌》中“利眾如來云：故意宰殺肉，或見或聞疑，其肉不得食。”一偈解釋為或見或聞或疑為我殺者，但也有些論典說凡是為食肉而宰殺者，全為不凈肉，如釋迦光論師所著的《毗奈耶具光論》云：“不食故意宰殺之魚肉等，若殺或勸殺、及隨喜殺者，雖是三凈肉，但故意宰殺乃無慈悲心故，亦非合理，不得食用，余肉乃無遮也?！?
但大乘經論對食肉作了嚴格的遮止，如《大象力經》、《大云經》、《涅槃經》、《指經》、《楞伽經》、《善臂請問經》以及中觀等論中廣說了食肉的過患。在《楞伽經》中佛告大慧菩薩：“大慧，我有時說，遮五種肉，或制十種。今于此時，一切種，一切時，開除方便，一切悉斷。”又如經云：“何人食用肉，先墮餓鬼眾，后墮號叫獄。”寂天菩薩在《集學論》中說聲聞乘開許三凈肉亦是不了義的抉擇，因要引食肉者漸次入佛門故，并引《楞伽經》說明。薩迦班智達的《辯三戒論》云：“聲聞可食三凈肉，若彼凈肉不食者，是乃提婆之禁行，大乘經論遮食肉。”藏地全知果仁巴在《辯三戒論釋善解佛意疏》中亦作如是宣說。
但是，有些寡聞無智的人，認為吃肉的全是外道，或因此而戒律不清凈，這是一種偏見。難道佛陀在小乘經典中開許食用三凈肉，于是這些經典也成了外道書籍嗎？如今佛教信徒占人口百分之九十五以上的泰國、不丹、斯里蘭卡、緬甸等佛國的教徒們，不僅是居士食肉，出家人中也少見素食者，那這些國家的所有僧俗，全是戒律不凈者嗎？這是否僅是一個坐井觀天的精彩故事呀！
又有人認為只有漢地顯宗崇尚素食，藏地學密者則全是食肉的，其實不然，除食用三凈肉者外，藏地還有相當一部分僧眾與居士倡導并奉行素食。五明佛學院每當打齋供僧時，總要準備一大鍋素飯，以方便藏漢兩族吃素的僧眾。在四川省紅原縣，有一活佛，在他第一世時，發愿七世中不進肉食，現在是第二世，從小見肉就哭泣不已，至今已成年，戒肉茹素依然如故。
若有人想：“漢地《梵網經菩薩戒本》中說：‘夫食肉者，斷大慈悲佛性種子，一切眾生見而舍去。'食肉教徒對此經作何解釋？”殊不知在藏地所傳的兩種菩薩戒，屬于由龍樹、無著二大菩薩所傳的瑜珈部，均有別于漢地。龍樹菩薩的甚深見派菩薩戒中有十九條重罪，八十輕罪，無著菩薩的廣大行派中菩薩戒有四重罪，四十六輕罪，在其戒條中，雖未見開許處，但也未見遮破食肉。另外，《梵網經》中此不食肉戒列為四十八輕垢罪之一，非犯根本重罪，與“別請僧”、“不行救贖”、“懈怠不聽法”等輕垢罪并列，此后三條均極易犯，并未見重視，獨重視此不食肉戒似亦非應理。若想：食肉過患既墮惡趣，則應非輕罪耶？答：這也不一定，因食肉過失雖墮地獄，然仍較易懺悔清凈。又如《宣說輕重罪經》說：“比丘犯一白衣輕罪，亦需在復活地獄受八萬年苦。”
依據錯那·西繞桑波的《毗奈耶根本論日光疏》所述，在末法時代，能保持根本戒不犯，即為戒律清凈。法王如意寶的《教誨甘露明點》也云：“根本墮罪與自續，常非并存為凈戒?！庇谑硟羧庹邅碚f，別解脫戒未犯，菩薩戒中依《梵網經》也只犯輕垢罪，且此輕垢罪通過懺悔也即可清凈。如漢地共稱的清凈比丘中，也有午后食飯或懈怠不聽法者。是故，無論守持何戒，應以戒體之輕重為主，不能僅看表面形象。如今見他人犯根本重罪，不覺有過，對犯輕罪者，卻極為見怪，并立為破戒，如是判斷，是否應理，尚請三思！
綜上所述，戒肉茹素有無量的功德，食肉則有極大過患，但在藏地，佛教徒食用三清凈肉于菩薩戒與別解脫戒均不為破，更不等同于殺生與外道的行為。所以，以藏漢為主的所有佛教徒，應該團結和合，互相尊重，不得誹謗，應知都為世尊所傳下的清凈教派，都有解脫道。廣學實證的人，由此可證藏漢互通，顯密不違，各派圓融矣。
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