與前期相比，中后期歷代國(guó)玉更加崇奉佛教。他們當(dāng)中有不少人受菩薩戒，經(jīng)常讀經(jīng)拜佛。常請(qǐng)禪僧說(shuō)禪，設(shè)百座法會(huì)請(qǐng)僧講經(jīng)，舉辦各種修懺法會(huì)，或求雨，或祈福消災(zāi)，或求國(guó)泰民安，公元10世紀(jì)末至11世紀(jì)初，北方契丹3次入侵，11至12世紀(jì)之交，女真入侵，13世紀(jì)，蒙古前后6次入侵。

　　在這種情況下，篤信佛教的國(guó)王一再到寺院設(shè)供，舉辦法會(huì)，甚至發(fā)愿和實(shí)施雕印《大藏經(jīng)》，祈求佛菩薩和善神的佑助，擊退外敵，國(guó)王濫建寺院，度良民為僧，向寺院施舍大量土地財(cái)物，對(duì)國(guó)家財(cái)政構(gòu)成嚴(yán)重危脅。忠宣王五年（1313）讓位于忠肅王，自為“上王”，每天飯2千僧，點(diǎn)2千燈，5日可飯僧1萬(wàn)，點(diǎn)燈1萬(wàn)，稱之為“萬(wàn)僧會(huì)”。浪費(fèi)之大由此可見(jiàn)。

　　由于佛教勢(shì)力急劇膨脹，僧侶在政治上的影響也增大。

　　仁宗（1123—1146在位）寵信的僧人妙清，權(quán)勢(shì)很大，最后謀反，遭到朝臣?xì)⒑?。恭愍王?352—1374在位）寵信僧人遍照（辛?xí)H），讓他參與國(guó)政，權(quán)力傾朝，“百官詣門(mén)議事”，后以“謀逆”罪被朝臣處死。此外，在明宗（1171年）和高宗時(shí)（1217年）都發(fā)生僧人武裝暴亂事件，人數(shù)成百上千，被殺的很多。

　　關(guān)于高麗中后期社會(huì)上流行的佛教宗派，史書(shū)上有所謂“五教二宗”的說(shuō)法。但具體所指，有不同的見(jiàn)解。常見(jiàn)的說(shuō)法說(shuō)：“五教”包括戒律宗、法相宗、法性宗（三論宗）、圓融宗（華嚴(yán)宗）、天臺(tái)宗；“二宗”指禪寂宗（禪宗）以及新成立的曹溪宗（也屬禪宗系統(tǒng)）。但在一般書(shū)中，“五教二宗”往往是整個(gè)佛教界的代稱，如元宗二年（1261）“設(shè)五教法席于內(nèi)殿”，十四年（1273）“幸賢圣寺，集五教兩宗僧徒”，恭愍王十九年（1370）“設(shè)工夫選，大會(huì)兩宗五教袖子”等等?！拔褰獭焙?jiǎn)稱“教”，指禪宗以外的以佛教經(jīng)論為依據(jù)的宗派，“二宗”簡(jiǎn)稱“宗”，指“教外別傳”的禪宗。

　　為選拔高級(jí)僧人指導(dǎo)傳教和管理僧尼事務(wù)，從高麗初期就開(kāi)始設(shè)置僧侶考試制度，至宣宗時(shí)（1084—1094）制度已達(dá)完備。一般稱此為“僧科”。僧科仿進(jìn)士科舉制，每3年一選，試以佛教經(jīng)、論。到高麗末年以至李朝時(shí)期，禪宗僧則試以《景德傳燈錄》及高麗慧湛的《禪門(mén)拈頌集》；教宗僧則試以《華嚴(yán)經(jīng)》及《十地經(jīng)論》。通過(guò)僧科考試，僧人可得到不同的階位。禪宗的法階有大選、大德、大師、重大師、三重大師、禪師、大禪師；教宗的法階有大選、大德、大師、重大師、三重大師、首座、僧統(tǒng)。全國(guó)最高的僧官是“王師”和“國(guó)師”。王師與國(guó)師必須從上述禪宗的禪師、大禪師和教宗的首座和僧統(tǒng)中任命。

　　高麗的僧尼管理制度是仿照唐宋而建立的。新羅時(shí)期已設(shè)僧官，高麗王朝繼承并有發(fā)展，設(shè)左右街僧錄司統(tǒng)攝僧眾，主管一切佛教事務(wù)及賓館威儀的事情。僧錄司設(shè)僧維、僧正、副僧錄、都僧錄，統(tǒng)攝兩街僧錄的是左右兩街僧統(tǒng)。

　　高麗末年，隨著儒學(xué)的興起，佛教的干政和日趨腐敗，逐漸引起排佛之風(fēng)。高麗忠烈王時(shí)（1275—1308）置國(guó)學(xué)，派人入元畫(huà)回孔子和72弟子像供奉，購(gòu)祭器及儒家經(jīng)書(shū)，建大成殿和學(xué)宮，培養(yǎng)儒生。此后儒學(xué)漸興，恭憨王十六年（1367）命鄭夢(mèng)周等為學(xué)官，增置生員，授朱亮《四書(shū)集注》，“程朱性理之學(xué)始興”。鄭夢(mèng)周被推為“東方理學(xué)之祖”，令土庶仿朱子家禮，立家廟，奉祖先之把，致力發(fā)展儒學(xué)。辛昌（廢王）時(shí)（1388）典法判官趙仁沃上疏指出佛教“固非所以治天下國(guó)家之道”，批評(píng)“近世以來(lái)，諸寺僧徒不顧其師寡欲之教，土田之租、奴婢之傭，不以供沸僧而以自富其身；出入寡婦之家，污染風(fēng)俗：賄賂權(quán)勢(shì)之門(mén)，希求巨利，其于清凈絕俗之教何？”建議收土地于官府，對(duì)僧徒嚴(yán)加管理。恭讓王二年（1390）儒者鄭夢(mèng)周上奏說(shuō)儒者之道“至理存焉，堯舜之道亦不外此”，而佛教教人“辭親戚，絕男女，獨(dú)坐巖穴，草衣木食，觀空寂滅為宗”，不是“平常之道”。此后，大司憲成石璘等人又上疏，批評(píng)佛教”無(wú)父無(wú)君”，“以毀綱?！?，師其法必國(guó)滅絕祀。直到高麗滅亡前夕，大臣和儒者鄭道傳等多人連續(xù)上疏批評(píng)佛教妄談禍福，勞民傷財(cái)，危害國(guó)家，應(yīng)當(dāng)革除。這些排佛之論，是李朝興儒排佛的先聲。